38号公告第三条规定，增值税一般纳税人取得的增值税专用发票纳入异常凭证范围，大致可分为三种情况进行处理。

情况一

对异常凭证计入进项税额的纳税人，暂不扣除未扣除的异常凭证，应转出已扣除的进项税额；

情况2

异常凭证用于出口退税的纳税人，对尚未退还的异常凭证，暂停出口退税，已退还的应补缴退税款；

情况3

异常凭证用于消费税抵扣的纳税人，参照增值税处理办法，即未抵扣的异常凭证暂不抵扣，已抵扣的抵减可抵扣消费税或补缴消费税。

同时，38号公告为取得异常证明的纳税人提供税收减免。纳税人对异常凭证认定有异议的，可以向主管税务机关申请核查，经核查符合相关要求的，可以继续申报抵扣、申请出口退税或者申报抵扣消费税。

需要注意的是，取得非正常凭证并已申报增值税抵扣、出口退税或消费税抵扣的纳税信用A类纳税人，可在接到税务机关通知之日起10个工作日内及时申请核查。如果确实符合相关规定，不得转让进项税、收回已退税款、抵扣消费税等。，这充分体现了税收抵免的价值。